遇到在微星主板电脑上启动PE系统后出现蓝屏的问题，可以尝试以下几个步骤来排查和解决问题：

1. 检查硬件问题：确保所有设备正确安装且兼容。有时蓝屏可能由内存条或其他硬件故障引起。

2. BIOS设置：重启电脑进入BIOS（通常是按Del或F2键），检查是否开启了Secure Boot，将其设置为"关闭"可能会解决问题。还可以调整一些兼容性相关设置如UEFI模式选择（从UEFI改为Legacy或者相反），以及启用或禁用某些设备等。

微星主板进pe系统蓝屏 第1张

3. 操作系统驱动问题：如果在PE中尝试安装新的驱动程序时遇到困难，这可能导致系统无法稳定运行而引发蓝屏错误。

4. 更新BIOS至最新版：前往微星官网下载并安装适用于您的主板的最新BIOS固件更新，有时候旧版本的BIOS会跟特定的操作环境存在兼容性问题。

5. 检查USB设备：如果使用USB启动PE，请试更换不同端口或者替换另一个U盘试试。

6. 安全模式启动：部分蓝屏是由于第三方软件冲突导致，尝试进入系统的Safe Mode看是否有改善。

7. 日志查看器：记录蓝屏的具体错误代码可以帮助定位问题。你可以通过“查看事件查看器”里的Windows日志>系统或应用程序找到具体的蓝屏信息。

微星主板进pe系统蓝屏 第2张

8. PE兼容性测试：有可能问题出在你所使用的那个PE系统镜像本身不完善。可考虑下载其它品牌、版本的轻量级PE系统试试。

9. 检查硬盘/SSD驱动器状况：运行硬盘自检工具检查硬件健康状态。

以上这些方法覆盖了常见的处理方式，若经过上述步骤仍无改善的话，可能是比较复杂的专业技术性问题或者存在某种不常见的bug，则可能需要求助专业的技术人员或者联系厂家客服进一步支持。